苏军方面，为了共同抵御厄普西隆，苏俄与仲国打算在在新加坡谈判。在尤里的层层阻挠中交换战俘后，谈判开展。
仲苏联军抵挡了一波波厄普西隆的进攻，谈判得以顺利进行，罗曼诺夫总理不顾危险亲自到场谈判最终打动了仲国代表，将军同志的表态也成功让各方代表让步，龙与熊最终和解。
之后，仲国大方的将自已的“半机械先驱”的科技资料分享给了苏俄与拉丁同盟，这是仲国利用研究沃尔科夫获得的科技研发出来了一种量产型半机械人。作为交换条件，苏俄也将自已的部分反心灵科技分享了出去。
之后，仲国为表诚意，命令菲律宾的海军开往托托亚岛，目的是岛上即将从月球降临的一个代号为王牌的厄普西隆重要人物。
然而在损失了几乎所有部队后，目标还是未能达成。又由于大量部队出动，菲律宾基地被厄普西隆渗透，仲国首席科学家的位置也被尤里发现。
在以提供机械化武器和EMP技术的科技为前提下，仲国要求苏俄提供海军来弥补海军力量的大量损失，同时前往克什米尔协助防守厄普西隆的攻击，保护一名名叫云茹的仲国首席科学家。
琪裁同志立刻出动，带领着莫拉莱斯和一支拉丁同盟的精锐部队前往了克什米尔。在仲国守军的高科技装备及拉丁同盟精锐的双重打击下，厄普西隆的部队很快就被歼灭了。
而苏俄和拉丁同盟在见识到云茹研发的新型武器的威力后，也分享了磁暴科技与火焰科技，获取了部分原型实验兵器的设计图。
然而尤里并没有完全放弃，他仍尝试派遣“异教”和“王牌”天秤进行刺杀云茹的尝试，但都被一一化解。
最终天秤的心灵抑制器甚至被EMP干扰失效，导致天秤狂暴化，最终厄普西隆不得不全力回收天秤并放弃刺杀。
盟军方面，澳大利亚的太平洋阵线成功与悖论远征军取得了联系，他们帮助太平洋阵线穿越巴拿马银河来到了维尔京群岛上，岛上有着开发可以操纵天气的超级武器研究基地。
在坚守住了厄普西隆的进攻后，天气控制仪成功启动，消灭了所有群岛上的厄普西隆有生力量。盟军终于有了可以媲美战术核弹的超级武器。
为了扩充本不富裕的兵力，盟军解救了位于波多黎各岛上的圣胡安市的霉菌残部。盟军内部也为之前窃取科技的行为互相道歉，最终和解。
厄普西隆方面，为了削弱仲国实力，也是见识到了金川工业的潜力，他们出动了大量部队前往日本。
虽然仲日联军损失惨重，但还是抵挡住了厄普西隆的大量部队。这也让仲国意识到必须坚守重要目标，将所有海外基地全部撤到了本土即日本。
虽然并没有取得战果，但在进攻途中遇到的一种新型防御塔让尤里获得了极大的启发。
另一方面，由于厄普西隆的重重失败，悖论引擎带来的震撼，天秤带来的恐惧，拉什迪对前途感到的担忧，天蝎组织背叛了厄普西隆。
虽然最后拉什迪的宫殿在“异教”势如破竹的攻势下被毁，但拉什迪本人却逃离了出来，剩余的天蝎组织部队也拒不投降。
在心灵控制了部分天蝎组织的俘虏后尤里得知了拉什迪之前开发的一种可以免疫心灵控制的神经毒素，正是这种毒素使的拉什迪不受心灵控制。
而拉什迪已将这个消息告诉了苏联，苏联部队比厄普西隆更快的来到了埃及。在付出极为惨烈的代价后，神经毒素工厂最终被毁。但这不顾一切的进攻也让厄普西隆的非洲军团损失惨重，最终只能撤离非洲。
目前多亏了将军琪裁，实力保存的最完整的苏联开始准备“大审判”计划。虽然计划名字看着不明所以，但是将军本人“这个名字不是很帅吗”这样强烈建议过，高层也决定照顾一下这个年轻有活力的将军。
首先是雷泽诺夫和库可夫清理了满是感染者和生化病毒的西班牙萨拉戈萨州，同时苏俄利用仲国的科技，整合了欧洲的卫星系统。
利用这个卫星，苏俄发现了厄普西隆位于瑞典的航天站。整合了来自仲国的信息，苏俄认为代号“天秤”的超级士兵很可能就是利用那些这些不断升空降落的航天器降落了。很快琪裁就被派往此处。
利用契特卡伊成功控制了厄普西隆空中要塞伊利卡拉后，苏俄更加顺利摧毁了此处的心灵支配仪，并占领了此处航天站。之后发现，这些太空舱的目的地是月球，因此苏俄推测月球可能有着厄普西隆的重要基地。
也是在琪裁的带领下，一支经过改装的特殊部队登陆到了月球。在占领了月球后，苏俄也有了向全球投送部队的能力。
在非洲，天蝎组织一直没有放弃反抗。而另一边的盟军悖论远征军，在解决了对悖论引擎的威胁和资源枯竭的问题后，也一路高歌猛进，终于还是来到了非洲现在正是厄普西隆最头痛的时候。
情报才是最重要的东西，将军同志深知这一点，于是利用了集合能利用的一切，不断观察着盟军方面正发生着什么。
观察到盟军正在朝南极进发，同时之前被偷的老式超时空传送仪发送的信号位置也在南极，琪裁第一时间请示了苏军高层，希望能够派兵南极。
在将军同志的坚持和亚历山大总理的信任下，苏俄勉强派出了一支先锋队打探情报。
同时月球基地的情报显示，尤里本人正待在莫斯科。虽然琪裁本人也有点动摇，但最后还是决定等待侦查部队的报告。
事实证明，琪裁是正确的。尤里在莫斯科的挑衅是调虎离山，他真正的总部是在南极洲。那里有座不明巨塔，不管怎么说放着那巨塔不管不可能是个好主意。
盟军已经展开了强烈的攻势，几乎所有的盟军部队都在进攻南极，可见巨塔的可怕。
尽管盟军的攻势看起来如此顺利，但琪裁并不相信盟军。因此，“大审判”计划被推迟，为了捣毁厄普西隆的计划，顺便让盟军失去战力，苏联紧急派遣了一支远征部队前往了南极。
就在尤里利用老式超时空传送仪回到莫斯科不久前，他利用到手的超时空科技为“天秤”制作了一个超时空背包。
天秤为了取得这份礼物，途中意外解除了限制，实力大幅增强，消灭了大量盟军部队，以及那位太平洋阵线的英雄友川纪夫。
另一边苏联方面，在远征军开拔的同时，“大审判”计划也在准备当中。在与仲国交涉后，苏俄成功获得了大量仲国部队的支援。
乌拉尔方面军与仲国志愿军成功回收了天启坦克制造基地及图纸，斯大林格勒方面军及拉丁同盟志愿军成功解放了斯大林格勒。
为了不让尤里发觉苏联远征军，还位于欧洲的苏联部队将进行持续不断的骚扰和进攻。
之前，苏俄将厄普西隆的部分火箭改装成战略核导弹并安装到卫星系统上，但尤里却研究了伦敦的短剑防御系统并开发出了属于自已的天剑防御系统，这导致包括midas在内的远程战略武器都失去了作用。
苏联高层推测，这个防御系统不仅存在于欧洲，同时应该也存在于南极。
在南极洲外围海域观望一阵子后，盟军果然不出所料的出意外了。王牌武器悖论引擎的武器系统失效，最后王牌指挥官不得不亲自驾驶悖论引擎撞向巨塔。
虽然很悲壮，但是最后巨塔却仍保持着运转。盟军已经无兵可用，厄普西隆的增援部队却不断赶来，还有天秤这张王牌。为了彻底摧毁巨塔，一直潜伏着的苏联远征军终于只能出手了。
多亏盟军之前的努力，南极的重型防空设施已经几乎全灭，而剩下的防空武器面对如潮水般的基洛夫舰队几乎没有效果。
虽然南极不适合使用天启这种超重型坦克，但苏维埃强大的装甲集团冲锋也是轻易撕开了厄普西隆的防线！
在救出剩余的盟军部队后，联合远征军一路高歌猛进，很快又推进到了巨塔之下。此时的天秤已经进入巨塔，准备启动“心灵终结仪”。
这是个好处，因为天秤的强大有目共睹，联合军不必再面对这手撕战舰的怪物了。但这也说明了“心灵终结仪”即将启动，那时世上一切有心智的生物都将被尤里操纵。
巨塔十分坚固，但他并不是无敌的。在和盟军汇合后，苏军得到了一个令人振奋的事实，那便是midas核弹不会受到任何拦截。
在尝试性的朝着巨塔发射几枚战术核导弹后，苏军立即组织起撤离，同时位于非洲潜伏多时的白杨M在天蝎反抗军，霉军非洲残部与残存的苏俄非洲军团的保护下现身，在厄普西隆发现并摧毁它之前发射了最后一颗midas核弹。
......
心灵终结仪与厄普西隆主力被摧毁了，天秤肯定也死了，盟军已无翻身之日，不得不向联盟臣服。
尤里以如同待宰的羔羊，等待着我们审判的到来。悖论引擎的残骸已经送往克什米尔，云茹想必能研究出更加先进的武器吧。
