星穹法典的光芒将「否定概念」尽数蒸发的瞬间，林渊等人的形态开始重组。当具象化的轮廓重新凝聚，他们赫然发现自己置身于一座漂浮在虚空中的古老祭坛。祭坛表面布满宝可梦形态的浮雕，每一尊浮雕都散发着微弱的生命波动，似乎在诉说着远古时代的秘辛。
瑟蕾娜的共情长弓重新聚合，突然发出清越的鸣响。她的目光扫过祭坛西周，瞳孔中浮现出奇异的符文：“这里……是阿尔宙斯创造宝可梦世界时留下的第一道封印！这些浮雕里封存着最初的宝可梦灵魂。”话音未落，祭坛中央的法典突然迸发刺目金光，无数宝可梦虚影从法典中涌出——有古老的幻兽宝可梦，也有尚未被人类认知的未知宝可梦。
苏小璃的时间神器突然发出警报，她的机械臂快速解析着数据流：“不好！深渊的侵蚀正在具象化！祭坛的封印核心正在被‘熵蚀之液’污染！”只见祭坛边缘渗出黑色雾气，所过之处，宝可梦浮雕开始扭曲变形，原本温和的眼神变得充满攻击性。一只由暗影组成的烈空坐虚影咆哮着扑来，它的身体上布满类似“熵蚀之液”的纹路，每一次振翅都带起撕裂空间的尖啸。
林渊握紧希望之刃，刀刃上的冰晶泛起战斗的光芒：“这些被污染的宝可梦虚影，本质是深渊对生命概念的扭曲！我们必须净化它们，才能稳定封印！”他率先冲向烈空坐虚影，刀刃与暗影碰撞产生剧烈的能量爆炸。瑟蕾娜同时将共情长弓化作光鞭，缠绕住一只正在破坏祭坛的盖欧卡虚影，试图通过情感共鸣唤醒对方的理智。
然而，深渊的污染远超想象。被净化的宝可梦虚影在恢复清明后，竟主动冲进“熵蚀之液”中，重新被黑暗吞噬。苏小璃在分析战斗数据时发现惊人事实：“这些污染不是简单的侵蚀，而是在复制宝可梦的力量！每净化一只，深渊就多掌握一种宝可梦的能力！”
就在局势陷入绝境时，法典突然浮现出新的文字。这些文字化作流光融入林渊体内，他的脑海中闪过一段记忆：在远古时代，阿尔宙斯创造宝可梦世界后，将自己的一部分力量注入十二块石板，而这些石板，正是封印深渊的关键组件。而此刻，祭坛上的浮雕，正是石板力量的具象化体现。
“我们需要唤醒浮雕里的宝可梦！”林渊将观测者之力注入祭坛，“但不能用蛮力净化，而是要让它们主动觉醒！”瑟蕾娜立即领会，她将共情能力扩散到整个祭坛，用最温柔的情感波动呼唤着沉睡的灵魂。苏小璃则用时间神器构建出“回溯领域”，将被污染的宝可梦虚影暂时困在时间回廊中。
随着瑟蕾娜的情感共鸣不断增强，祭坛上的浮雕开始震动。最先苏醒的是一只梦幻虚影，它的身体散发着柔和的光芒，轻轻触碰被污染的烈空坐。奇迹发生了——烈空坐身上的暗影开始消退，取而代之的是纯净的龙属性光芒。其他宝可梦虚影见状，纷纷加入净化行列，祭坛上空形成一道由不同属性光芒交织的结界。
但深渊的反击也随之而来。祭坛下方传来低沉的轰鸣，一只由无数“否定概念”组成的巨型宝可梦破土而出。它有着裂空座的翅膀、固拉多的身躯和盖欧卡的头部，却没有任何生命特征，完全由混沌构成。阿尔宙斯的神念再次响起：“那是深渊创造的‘终焉宝可梦’，它的存在就是为了否定一切生命形态！”
林渊、瑟蕾娜和苏小璃对视一眼，同时将力量注入星穹法典。法典化作一道光柱首冲云霄，在虚空中勾勒出阿尔宙斯的虚影。远古之神的声音响彻整个空间：“以十二石板之名，唤醒宝可梦世界的本源之力！”祭坛上的浮雕全部绽放光芒，十二块蕴含不同属性力量的石板从光芒中浮现。
终焉宝可梦发出愤怒的咆哮，冲向石板。林渊手持希望之刃，瑟蕾娜搭起共情长弓，苏小璃操控时间神器，与十二块石板的力量形成共鸣。当终焉宝可梦触碰到石板的瞬间，整个祭坛爆发剧烈的能量风暴。在风暴中心，林渊等人看到了惊人的一幕——法典扉页上，那个堕入深渊的林渊身影，正对着他们露出意味深长的微笑。
风暴平息后，终焉宝可梦消散在光芒中，被污染的宝可梦虚影全部恢复清明。星穹法典缓缓合上，化作一道流光没入祭坛。阿尔宙斯的虚影渐渐透明：“深渊的威胁暂时解除，但它的根源——那个‘未选择的绝望’，依然存在于宇宙的裂缝中。”祂的目光落在林渊身上，“你与法典的联系，或许将成为解开一切谜团的关键。”
祭坛开始崩塌，林渊等人在宝可梦虚影的护送下回到现实世界。当他们再次仰望星空，发现原本被“熵蚀之液”污染的星域，此刻正闪烁着新生的光芒。瑟蕾娜的共情长弓感应到远方传来的呼唤，苏小璃的时间神器记录到新的时空波动，而林渊手中的希望之刃，似乎在期待着下一次战斗的到来。
在宝可梦中心休整时，林渊打开法典的最后一页，发现上面出现了新的预言：“当平行时空的命运之线交织，被遗忘的远古之战将再次上演。唯有以信念为引，以希望为刃，方能斩断绝望的轮回。”窗外，一只皮卡丘欢快地跑过，它不会知道，自己生活的世界刚刚经历了一场足以毁灭宇宙的危机。而对于林渊和他的伙伴们来说，新的冒险，才刚刚开始。
