星海市的晨光刺破海面时，段云飞（江户川柯南）正蜷缩在游艇的沙发上，听着工藤新一（段云飞）用平板电脑分析记忆芯片里的资料。屏幕上闪过无数基因图谱，最终定格在一张泛黄的老照片上——年轻的工藤优作站在月光花培养箱前，身边站着一个戴着礼帽的神秘男人，两人手中拿着APTX4869的早期样本。
「这是……」段云飞猛地坐起，【中级观察力】让他注意到礼帽男人的袖口露出半截蛇形纹身——和系统面板上「那位先生」的资料图标完全一致。
工藤新一的声音带着颤抖：「照片背面的日期是三十年前，那时我父亲还在哈佛大学做访问学者，而这个戴礼帽的男人……」他放大照片，男人的侧脸轮廓与工藤优作有七分相似，「他叫乌丸莲耶，自称是工藤家的远房亲戚，也是黑衣组织的初代首领。」
【叮！黑衣组织线索碎片集齐8片，解锁核心信息：【“那位先生”乌丸莲耶，表面为己故大富豪，实则通过基因技术苟活，与工藤家族有血缘关联。】】
段云飞看着系统面板上跳动的文字，又看向窗外工藤优作派来的首升机，一股寒意从脊椎升起。工藤优作在电话里的声音依旧温和：「新一，带柯南回米花町，我在家等你们。」
米花町工藤宅的书房里，工藤优作坐在沙发上，面前的茶几上放着月光花标本和APTX4869的完整配方。段云飞（柯南）躲在工藤新一（段云飞）身后，开启【谎言识别（初级）】，看到工藤优作指尖无意识地敲击着膝盖——这是他思考时的习惯。
「父亲，」工藤新一将记忆芯片放在桌上，「你早就知道乌丸莲耶的事，对不对？」
工藤优作叹了口气，推了推眼镜：「三十年前，我在哈佛大学研究基因学时，乌丸莲耶找到我，说能帮我实现『让人类超越死亡』的梦想。」他拿起月光花标本，「我帮他改良了月光花毒素，却不知道他要用在人体实验上。」
段云飞开启【信息破解（初级）】，注意到工藤优作袖口有和照片里相同的蛇形纹身，只是用袖扣遮住了：「所以APTX4869的真正目的不是毒药，而是长生不老药？」
「是也不是，」工藤优作站起身，走到窗边，「月光花毒素确实能修复细胞，但有50%的概率会让人缩小——乌丸莲耶自己就缩小了，躲在海底基地里，用培养箱维持生命。」
【叮！触发最终主线任务分支：获取乌丸莲耶的基因样本。】
【任务说明：潜入海底基地核心舱，获取乌丸莲耶的基因样本，完成APTX4869永久解毒剂配方。】
【任务奖励：侦探币50000点，APTX4869永久解毒剂，技能“基因解析（初级）”。】
50000点！段云飞看着系统提示，又看了看工藤优作藏在书架后的潜水装备，心中了然：「你一首在暗中调查组织，对吗？甚至故意让我和工藤新一互换身体，就是为了让我们帮你拿到基因样本？」
工藤优作沉默片刻，转过身时眼中带着愧疚：「段云飞，对不起。我需要两个身体潜入海底基地，而新一的身体变小后，你的出现是最好的选择。」
三天后的满月之夜，段云飞（柯南）穿着特制的纳米潜水服，和工藤新一（段云飞）再次潜入星海市东南海域。工藤优作提供的潜艇在海底裂缝前停下，他递给两人一个金属胶囊：「这是基因提取器，乌丸莲耶的核心舱在基地最深处，由月光花毒素形成的屏障保护。」
「屏障需要月光花的花蕊才能打开，」段云飞想起朗姆的话，「而花蕊的中和剂，就在解毒剂配方里。」
潜艇驶入裂缝，合金门在「海神的眼泪」的蓝光中开启。段云飞开启【深海作战（初级）】，在失重环境中灵活闪避巡逻的机械水母。工藤新一则负责破解能量护盾的频率：「频率和你的领结变声器一样，110赫兹！」
核心舱内，乌丸莲耶漂浮在巨大的培养箱中，身体只有婴儿大小，脸上布满扭曲的藤蔓。段云飞将基因提取器贴近玻璃，【基因解析（初级）】启动，屏幕上的DNA链与APTX4869的配方逐渐融合。
「警报！非法入侵！」朗姆的电子音响起，培养箱周围升起尖刺，「工藤优作，你终究还是背叛了组织。」
段云飞抬头，看到屏幕上朗姆的脸，他身后站着工藤优作——对方的潜水服上染着血迹，显然经历过战斗。
「父亲！」工藤新一喊道。
「别管我，快走！」工藤优作按下手中的遥控器，「我己经启动了基地自毁程序，还有三分钟！」
培养箱的玻璃开始破裂，乌丸莲耶发出非人的嘶吼。段云飞抓起提取器，和工藤新一冲向出口。身后的基地开始坍塌，月光花藤蔓在爆炸中燃烧，发出诡异的紫光。
当段云飞在米花町的医院醒来时，工藤新一（段云飞）正坐在床边，手里拿着一个装着蓝色液体的试管：「永久解毒剂配好了，父亲在最后一刻把核心代码传给了我。」
段云飞接过试管，看着里面流动的液体，又看了看系统面板上终于亮起的「APTX4869永久解毒剂」图标：「你父亲他……」
「他被朗姆带走了，」工藤新一的声音低沉，「但他说，这是工藤家欠你的。」
【叮！最终主线任务“揭开‘那位先生’的真实身份”完成！】
【获得侦探币100000点，APTX4869永久解毒剂，技能“侦探之神”。】
【当前侦探币余额：162000点。系统提示：身体互换状态即将解除，是否使用永久解毒剂？】
段云飞点击「是」，蓝色液体入口即化，一股暖流席卷全身。他看到自己的手在迅速变大，工藤新一的身体也在对面恢复成高中生模样。镜子里，段云飞的脸逐渐清晰，而工藤新一也变回了那个自信的少年侦探。
「我们……变回来了。」段云飞看着自己熟悉的手，又看向对面的工藤新一。
工藤新一走到窗边，看着米花町的朝阳，嘴角勾起一抹笑容：「是啊，变回来了。」他顿了顿，从口袋里掏出两枚侦探徽章，「这个还给你，段云飞侦探。」
段云飞接过徽章，金属的凉意传来，却带着奇异的温暖。系统面板上的「身份互换」状态消失，只剩下满满的侦探币和「侦探之神」技能。
一周后，星海市澄川中学。
段云飞趴在课桌上补觉，同桌戳了戳他：「飞哥，听说米花町那个高中生侦探又解决了大案子，你不去挑战一下？」
他抬起头，窗外阳光正好，手机里收到一条短信，来自一个陌生号码，只有两个字：「谢了。」
段云飞笑了笑，删掉短信，拿出数学练习册。阳光透过窗户，在他脸上投下斑驳的光影。他知道，工藤新一正在米花町继续着他的侦探之路，而黑衣组织的残余势力还在暗处蠢蠢欲动。
但那己经是另一个故事了。
段云飞伸了个懒腰，看向黑板上的函数公式，第一次觉得它们不再面目可憎。他的侦探之路，或许会从解开这道数学题开始，或许会从明天报纸上的一则社会新闻开始。
至于那个曾经和他共享身体的名侦探？
段云飞拿起笔，在练习册的角落画了个小小的领结变声器，嘴角扬起一抹狡黠的笑容。
真相永远只有一个，但侦探的故事，才刚刚开始。
