毛利小五郎正坐在侦探事务所里，翘着二郎腿，面前的桌子上堆满了啤酒罐。突然，事务所的门被猛地推开，一个年轻帅气的男子风风火火地闯了进来。毛利小五郎被这动静吓了一跳，不满地瞪向来人。
“毛利侦探，我有个棘手的案子想拜托您。”男子急切地说道。毛利小五郎上下打量着他，不屑地哼了一声：“哟，看你这着急的样子，先把事情说清楚。”男子深吸一口气，开始讲述起来。原来，他的家族企业遭遇了商业间谍的破坏，重要机密文件被盗，公司面临巨大危机。
毛利小五郎摸着下巴，眼中闪过一丝锐利：“哼，这案子有点意思。不过报酬可不会便宜。”就在这时，另一个气质冷峻的男子也走进了事务所，他的目光在毛利小五郎和年轻男子身上扫过，淡淡地说：“我也对这个案子感兴趣，或许我们可以合作。”毛利小五郎挑了挑眉，看着这两个不速之客，一场充满挑战的调查就此拉开帷幕。
毛利小五郎，一个颇具特色的私家侦探。他身材微胖，一头乱蓬蓬的头发，眼神中时常透着一种慵懒与玩世不恭。平时总是穿着那套标志性的西装，嘴里叼着香烟，一副大大咧咧的模样。
在事务所里，他常常翘着二郎腿，看着赛马节目，幻想着能中个大奖，过上悠闲自在的生活。一旦有委托上门，他便会瞬间变得精神抖擞，虽然有时候推理的方向会跑偏得厉害，但他那自信满满的样子倒也让人忍俊不禁。
在案件调查过程中，他风风火火，横冲首撞，常常把现场搞得一团糟。不过，他也有着自己的正义感和责任感，为了查明真相，不惜付出努力。每当柯南用麻醉枪让他陷入沉睡，然后借他之口揭开案件的真相时，他醒来后还会洋洋得意，自诩为“名侦探毛利小五郎”，西处宣扬自己的功绩，引得旁人暗自偷笑。他就是这样一个让人又爱又恨，充满了喜剧色彩的人物。在繁华都市的背后，隐藏着无数的谜团与罪恶。高中生侦探工藤新一，因追查神秘黑衣组织而被灌下毒药，身体竟意外缩小成小学生模样，从此化名江户川柯南寄住在毛利侦探事务所。
一天，毛利小五郎接到一桩棘手的委托。富商的家中发生了离奇的盗窃案，珍贵的宝石不翼而飞。柯南随着小五郎来到现场，敏锐的他很快就发现了一些常人难以察觉的线索。现场留下的脚印、被破坏的窗户以及一些奇怪的划痕，都在柯南的脑海中逐渐拼凑出真相的轮廓。
在调查过程中，柯南结识了富商家中的几位可疑人物，每个人都有着自己的秘密和动机。他巧妙地利用阿笠博士发明的道具，隐藏身份暗中调查。经过一番抽丝剥茧的推理，柯南终于锁定了真正的窃贼——竟是富商身边看似忠诚的管家。管家为了偿还巨额债务，精心策划了这场盗窃案。
在关键时刻，柯南借助麻醉针让小五郎陷入沉睡，再用变声器模仿小五郎的声音，揭露了管家的罪行。最终，宝石物归原主，案件圆满解决。而柯南，又将继续以小学生的身份，在充满谜团的世界里，用智慧和勇气揭开一个又一个真相。没过几天，毛利小五郎又接到了新的委托。这次是一家知名博物馆报案，馆内的几件稀世文物被盗，而且现场还留下了神秘的符号。柯南和小五郎赶到博物馆，看着那神秘符号，柯南眉头紧锁，首觉告诉他这背后定有更大的阴谋。
与此同时，之前那个气质冷峻的男子和年轻男子也来到了博物馆。冷峻男子观察着现场，目光犀利，似乎也发现了一些端倪。年轻男子则在一旁协助收集线索。
在调查过程中，他们发现这些被盗文物似乎和一个古老的传说有关。传说中，集齐这些文物就能开启隐藏的宝藏。众人顺着线索一路追查，发现了一个隐藏在城市暗处的神秘组织。这个组织妄图利用文物的力量达成不可告人的目的。一场惊心动魄的较量即将展开，柯南、毛利小五郎、冷峻男子和年轻男子能否联手挫败神秘组织的阴谋，让文物重归博物馆呢？众人很快锁定了神秘组织的一处据点。他们趁着夜色，小心翼翼地潜入其中。刚一进去，就触发了机关，无数飞箭射来。冷峻男子反应迅速，拉着大家躲到一旁。柯南则利用眼镜上的追踪功能，寻找着文物的下落。在一个地下室里，他们终于找到了被盗的文物，可周围也布满了神秘组织的成员。双方立刻展开了激烈的对峙。年轻男子毫不畏惧，率先冲了上去与敌人搏斗。柯南则在一旁寻找机会，用足球腰带射出强力足球，打乱敌人的阵型。毛利小五郎也不甘示弱，凭借着多年的侦探经验，巧妙地躲避攻击并反击。就在大家陷入胶着时，柯南发现了神秘组织头目想要启动文物的机关。他眼疾手快，用麻醉针射中头目，阻止了阴谋的发生。最终，他们成功击败了神秘组织，将文物安全送回了博物馆。经历这场冒险，西人也结下了深厚的友谊，准备迎接未来更多的挑战。平静的日子没过多久，一封神秘的信件送到了毛利侦探事务所。信上写着：“想解开终极谜题，就来废弃工厂。”柯南和毛利小五郎对视一眼，决定前往一探究竟。冷峻男子和年轻男子得知消息后，也加入了他们。当他们到达废弃工厂时，却发现这里布满了陷阱和谜题。每解开一个谜题，就会出现新的挑战。在破解过程中，他们发现这一切似乎和那个神秘黑衣组织有关。突然，一群黑衣人出现，将他们团团围住。双方再次展开了激烈的战斗。柯南利用道具巧妙应对，冷峻男子和年轻男子配合默契，毛利小五郎也展现出了惊人的战斗力。就在他们快要突围时，黑衣组织的头目现身了，他手中拿着一个神秘的装置，扬言要让整个城市陷入混乱。柯南等人能否再次化险为夷，阻止黑衣组织的阴谋呢？关键时刻，柯南发现了头目装置的弱点，他和伙伴们齐心协力，终于击败了头目，成功保护了城市。这场冒险让他们的友谊更加深厚，也让他们更加坚定了对抗邪恶的决心。
经历了这次危机，众人以为能迎来一段安稳时光。然而，不久后一封匿名邮件发到了毛利侦探事务所的邮箱。邮件里只有一张模糊的照片，照片上是一个神秘的建筑，周围弥漫着诡异的气息。邮件附带一句话：“这里藏着你们无法想象的秘密。”
柯南等人决定再次踏上探寻真相之旅。他们根据照片线索找到了那座建筑，刚踏入其中，便有一股寒意扑面而来。建筑内机关重重，每走一步都可能陷入危险。他们在黑暗中摸索前进，不断解开各种谜题。
随着深入，他们发现这里似乎是黑衣组织的一个秘密研究基地。突然，警报声大作，一群经过改造的机械守卫出现，向他们发起攻击。柯南凭借智慧指挥大家躲避，冷峻男子和年轻男子奋勇迎战，毛利小五郎也发挥出自己的实力。在激烈的战斗中，他们能否揭开这个基地背后的秘密，又能否再次战胜黑衣组织的阴谋呢？最终，他们突破重重困难，找到了关键线索，挫败了黑衣组织的又一次阴谋。就在众人以为又一次化险为夷时，基地突然开始剧烈摇晃，原来他们触动了基地的自毁程序。倒计时开始，每一秒都无比煎熬。柯南迅速冷静下来，带领大家寻找出口。在慌乱中，毛利小五郎不小心扭伤了脚，冷峻男子和年轻男子一左一右架着他，在柯南的指引下拼命奔跑。就在倒计时归零的前一刻，他们终于冲了出来，身后的基地瞬间爆炸，火光冲天。
经此一役，大家都有些疲惫，但他们知道黑衣组织不会就此罢休。回到事务所，众人开始分析新的线索，发现照片背后似乎还隐藏着一串神秘代码。柯南通过阿笠博士的帮助，解开了代码，竟指向了一个遥远的海岛。为了彻底铲除黑衣组织，他们决定再次出发，前往那座神秘海岛，迎接未知的挑战，一场更加惊险刺激的冒险即将拉开帷幕。昏暗的房间里，灯光闪烁不定，柯南正对着桌上的案件资料眉头紧锁。突然，手机铃声打破了寂静，是目暮警官打来的电话，又有一起棘手的案件发生了。
柯南迅速赶到现场，这是一栋豪华别墅，主人倒在书房中，身旁散落着文件。现场没有明显的打斗痕迹，死者表情平静却又透着诡异。柯南仔细地勘察着每一个角落，不放过任何细微的线索。他发现窗户有被撬动的痕迹，但奇怪的是，屋内并没有丢失财物。
询问了别墅里的众人，每个人都有自己的嫌疑和不在场证明。柯南陷入了沉思，突然，一个细节闪过他的脑海，死者手中紧紧握着的笔似乎有问题。经过进一步调查，柯南发现这支笔被做了手脚，里面藏着毒药。
通过对别墅人员关系的深入了解，柯南终于锁定了嫌疑人——别墅的管家。原来，管家因多年来的不公待遇怀恨在心，精心策划了这场谋杀。
在证据面前，管家承认了罪行。案件告破，夕阳的余晖洒在柯南身上，他望着远方，心中明白，还有更多的谜团等待他去解开。
